Composta por profissionais que desempenham as seguintes funções: coordenadora geral, coordenador de projetos, auxiliar administrativo, auxiliar de limpeza, cantineiras, assistente de comunicação, motorista e secretária executiva. 

A equipe administrativa da APAE garante o funcionamento e a sustentabilidade da organização. Suas responsabilidades incluem gestão financeira, recursos humanos, logística, comunicação e desenvolvimento de estratégias para obtenção de recursos. Além disso, prepara e serve lanches e almoços para assistidos e funcionários e cuida da limpeza e manutenção do imóvel.

Composta por coordenadora cliníca e por profisisonais como: fisioterapeuta, fonoaudiólogas, neuropediatra, psicólogas, terapeuta ocupacional, nutricionista, neuropsicopedagoga e estagiários.

A neuropediatra faz a avaliação, diagnóstico e tratamento de distúrbios neurológicos em crianças e adolescentes, monitora o desenvolvimento neurológico e trata condições como epilepsia, paralisia cerebral, transtornos de desenvolvimento e outras doenças neurológicas. O atendimento é integrado e inclui a coordenação com profissionais da equipe clínica e pedagógica para fornecer um plano de cuidados abrangente e individualizado. 

A psicologia tem como objetivo melhorar os comportamentos dos assistidos e orientar as famílias no sentido de que elas consigam lidar com seus filhos com deficiência. Além disso, trabalha a estimulação manual, senso-perceptiva, auditiva e atividades de vida diária.  

A fonoaudiologia envolve a avaliação, diagnóstico e tratamento dos assistidos. Fonoaudiólogos trabalham para melhorar a capacidade de comunicação, promovendo o desenvolvimento da linguagem oral e escrita, a articulação correta dos sons e a melhoria das habilidades auditivas e de processamento auditivo. Também atuam na reabilitação de dificuldades na deglutição. 

A terapia ocupacional é um processo de tratamento no qual o terapeuta ocupacional utiliza a atividade como recurso técnico, realizando intervenção física, psíquica, social e sensorial. Tais intervenções podem ser lúdicas, corporais, artísticas, criação de objetos e conhecimentos, organização dos espaços, cuidados pessoais, passeios, festas, diversas formas produtivas e vida cultural, entre outras.  

O serviço de fisioterapia visa a avaliação, diagnóstico e tratamento das condições motoras e funcionais dos assistidos. Fisioterapeutas trabalham para melhorar a mobilidade, força muscular, coordenação e equilíbrio dos indivíduos, promovendo a reabilitação física e a autonomia funcional. As intervenções são personalizadas e incluem exercícios terapêuticos, técnicas de mobilização, e orientação sobre posturas e movimentos adequados. 

A neuropsicopedagogia atua na interface entre saúde e educação, realizando avaliação e intervenção nos processos de aprendizagem e desenvolvimento cognitivo. O trabalho envolve identificação de dificuldades relacionadas a funções executivas, atenção, memória, linguagem e raciocínio, além de orientar estratégias pedagógicas e familiares que favoreçam o desenvolvimento global do assistido. A atuação é integrada à equipe clínica e pedagógica, fortalecendo o acompanhamento interdisciplinar.

A nutrição atua no tratamento de diversas doenças e distúrbios do corpo por meio da alimentação. O objetivo primordial da nutrição é proporcionar refeições que sejam não apenas equilibradas quanto aos nutrientes, satisfazendo as necessidades alimentares dos assistidos, mas também manter e promover a saúde, incentivando o desenvolvimento de hábitos alimentares saudáveis. 

Composta por professoras de atendimento educacional especializado (AEE) e psicopedagoga, dá apoio pedagógico aos assistidos.

O atendimento pedagógico é um componente fundamental para promover o desenvolvimento educacional e social das pessoas com deficiência. São utilizados recursos pedagógicos e de acessibilidade que eliminam barreiras para a plena participação dos alunos, considerando suas necessidades específicas.

Vinculado à equipe pedagógica está o Grupo de Convivência, onde assistidos desenvolvem atividades diversas (lúdicas, de interação, jogos, canto coral, apresentação teatral, produção de artesanato etc.).

A equipe social inclui assistente social, educador social e estagiário. Seu foco é a qualidade de vida, a inclusão social dos assistidos e a garantia de seus direitos.

Pessoas com deficiência intelectual e múltipla e suas famílias encontram, na APAE, escuta qualificada, atendimento socioeducativo e autodefensoria. É papel fundamental do assistente social conscientizar as famílias e a sociedade sobre os direitos e deveres das pessoas com deficiência, fazer interlocução com as instituições e serviços que compõem a rede assistencial do município e desenvolver projetos para o seu público-alvo.